Zámerom publikácie je predstaviť mikrobiotu čreva, teda spoločenstvo mikroorganizmov osídľujúcich predovšetkým zadné úseky tráviaceho traktu, ako zložku nevyhnutnú pre zabezpečenie optimálneho fungovania metabolických, fyziologických, nutričných a imunologických procesov organizmu. Mikrobiota čreva pomáha nielen pri trávení prijatých živín, ale je zapojená tiež do vývinu a regulácie imunitného systému, histologických štruktúr čreva, produkcie vitamínov či metabolizmu žlčových kyselín. Publikácia rozoberá taxonomické zloženie a funkcie mikrobioty tráviaceho traktu prežúvavcov, koní, svine domácej, hydiny a psov a zároveň približuje, ktoré faktory môžu narušiť jej citlivú rovnováhu. Keďže dysbióza je spojená s rôznymi ochoreniami, publikácia tiež pojednáva o súčasných možnostiach upevňovania zdravia zvierat cestou modulácie jej zloženia, ako je aplikácia probiotík, prebiotík, postbiotík, či transplantácia fekálnej mikrobioty.