Több száz évig aludtak, és egy új otthonról álmodtak az Androméda-galaxisban. Amikor végre felébredtek, a békéről dédelgetett álmaik darabokra hullottak. A gyarmatosítók - turiánok, salariánok, aszárik, emberek és más fajok - egy felderítetlen galaxissal és felfoghatatlan fenyegetésekkel néznek szembe. A Nexus a központ, amelyből a gyarmatosítók felderíthetik új otthonukat. De még azelőtt, hogy a bárkák egyáltalán megérkeznének, a hatalmas űrállomás kritikus sérüléseket szenved. Az egész küldetés veszélybe kerül, és Sloane Kelly biztonsági főnöknek kell helyreállítania a rendet, miközben versenyt fut az idővel, hogy leplezze az előttük álló fenyegetés valódi természetét. Ha kudarcot vall, az Androméda Kezdeményezés összeomolhat.